I serien får vi följa Lyra, en till synes helt vanlig, men modig flicka från en annan värld. Under sitt sökande efter en vän som kidnappats avslöjar hon en lömsk plan som har med stulna barn att göra. Det leder henne vidare in på ett uppdrag för att ta reda på vad det mystiska fenomenet som kallas för Stoft är för något.