En ensam läkare i Stockholm fångas i en omöjlig situation när en ung kvinna söker hans hjälp. Hon är gift med pastor Gregorius – en man läkaren avskyr med intensitet – och tvingas till äktenskapliga plikter som fyller henne med avsky. Desperat ber hon läkaren om ett sätt att slippa sin makes närmanden. Doktor Glas lovar att hjälpa henne. Men vad börjar som en medicinsk lögn – ett påhittat hjärtfel som kräver sexuell avhållsamhet – utvecklas till något mörkare. När pastorn vägrar respektera läkarens ordination och kvinnans lidande fortsätter, står Glas inför ett val som utmanar allt han trott sig veta om moral och plikt. I sin dagbok kämpar han med frågor som plågar: Är det rätt att ta ett liv för att rädda ett annat? Kan handling någonsin vara värre än passivitet? Och när ödet bjuder honom ett perfekt tillfälle – en varm sommardag, ett hjärtpiller, ett glas vatten – kommer han att ha modet att gripa det? Medan Stockholms sommarnätter aldrig blir riktigt mörka, tvingas doktor Glas att konfrontera sin egen natur. Han har alltid varit åskådare, aldrig handlare. Men när gränsen mellan rätt och fel suddas ut, och när kärleken kräver det omöjliga, upptäcker han att ensamheten är den värsta domen av alla. Kommer samvetet att plåga honom mer än handlingen själv? Eller är det värre att leva med vetskapen om att man inte vågade?