Världen styrs av Shinra Electric Power Company, ett mystiskt företag som utvinner Makoenergi av planetens livskraft. I storstaden Midgar har organisationen Avalanche, som motsätter sig Shinra, blivit en allt starkare motståndsrörelse. Cloud Strife, tidigare medlem av Shinras elitstyrka SOLDIER och numera legosoldat, hjälper gruppen utan att veta vilka enorma konsekvenser som väntar honom